RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	RAB11B	Q15907	218 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR52W1	Q6IF63	320 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	GFI1	Q99684	422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148		V9GY05	133 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148		A0A087WXM4	84 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ARSB	P15848	533 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	LGALS4	P56470	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	CFHR4	Q92496	578 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SSR3	Q9UNL2	185 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PDCD6	O75340	191 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ARG1	P05089	322 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	GLA	P06280	429 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	RAB3B	P20337	219 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	CDK2	P24941	298 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	UNC119	Q13432	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TM2D1	Q9BX74	207 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	AIP	O00170	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CA11	O75493	328 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	IL1A	P01583	271 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	FUT3	P21217	361 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	QRFP	P83859	136 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	P2RY14	Q15391	338 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CALY	Q9NYX4	217 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OPN1MW	P04001	364 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CD36	P16671	472 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR10A3	P58181	314 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	HES5	Q5TA89	166 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148		A0A087X0M5	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1B0GX30	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	IFITM5	A6NNB3	132 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	MMP23A	O75900	390 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CGB3	P0DN86	165 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CGB7	P0DN87	165 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CHAT	P28329	748 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CD34	P28906	385 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	SSTR5	P35346	364 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CLDN12	P56749	244 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZTK2	550 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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