RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	GPER1	Q99527	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	LYL1	P12980	280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SOX6	P35712	828 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	RSU1	Q15404	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM104	Q8NE00	496 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	GABRP	O00591	440 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	MAGEB3	O15480	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	HTR3B	O95264	441 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	IGF1	P05019	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	RAB3A	P20336	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	F2RL1	P55085	397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	DOC2B	Q14184	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	RYR2	Q92736	4967 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	LCE6A	A0A183	80 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TXNL1	O43396	289 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302		I3L521	148 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	ORC5	O43913	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	RUNX1	Q01196	453 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302		Q3ZCU0	254 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	OVOL1	O14753	267 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC31A2	O15432	143 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	FCGR1A	P12314	374 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	GNB1	P62873	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	GALE	Q14376	348 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKDCC-208	ENST00000490302	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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