RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 MROH7Q68CQ1 1323 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF532Q9HCE3 1301 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC22A20A6NK97 555 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNW1P05000 195 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GUSBP08236 651 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CECR9P0C854 216 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL12BP29460 328 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARL2P36404 184 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASIPP42127 132 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLDN18P56856 261 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RWDD2BP57060 319 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 HOXC5Q00444 222 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 HTR4Q13639 388 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q499Y3 187 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 VTCN1Q7Z7D3 282 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZIC4Q8N9L1 334 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR11G2Q8NGC1 345 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 LHFPL5Q8TAF8 219 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERMNQ8TAM6 284 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO32Q969P5 355 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASD2Q96D21 266 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GSDMAQ96QA5 445 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMDT1Q9H4I9 107 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLF12Q9Y4X4 402 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASB3Q9Y575 518 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.3□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATAD5Q96QE3 1844 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PRD5 423 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC5A10A0PJK1 596 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGSF23A1L1A6 192 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 A8MWP6 167 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF13O43567 381 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FCN3O75636 299 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GYPCP04921 128 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SOD3P08294 240 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RALBP11234 206 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPAM1P38567 509 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLDN6P56747 220 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM229BQ4G0N7 80 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 BEX5Q5H9J7 111 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ELP2Q6IA86 826 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CASC1Q6TDU7 716 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GABRG1Q8N1C3 465 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 LFNGQ8NES3 379 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLDN23Q96B33 292 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPD52L3Q96J77 140 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 OLFM3Q96PB7 478 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 UPK3BQ9BT76 320 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP58Q9BVL2 599 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSMD13Q9UNM6 376 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 BTRCQ9Y297 605 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ORC6Q9Y5N6 252 aa-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SBNO1A3KN83 1393 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 INSRP06213 1382 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRIN2BQ13224 1484 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM250H0YL14 139 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BN98 237 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPDU1O75352 247 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAC1P20366 129 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR4P46093 362 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 C21orf59P57076 290 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 IDI1Q13907 227 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 NNATQ16517 81 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKDD1AQ495B1 522 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2NLQ5JXB2 153 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSX9Q7RTT3 188 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM122BQ7Z309 247 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 MARCH3Q86UD3 253 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5T3Q8NGG3 340 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 NT5CQ8TCD5 201 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCGB1C1Q8TD33 95 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCTD4Q8WVF5 259 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2H4Q92759 462 aa-0.32□□□□□ -2.46
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADTRPQ96IZ2 230 aa-0.32□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms