RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 FUT3P21217 361 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 HTR2CP28335 458 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SSTR5P35346 364 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 DYNLT3P51808 116 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SSX1Q16384 188 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RAB12Q6IQ22 244 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.38□□□□□ -1.23
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SYN3-211ENST00000472027 OR9G1Q8NH87 305 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LEAP2Q969E1 77 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ARL11Q969Q4 196 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GFI1Q99684 422 aa7.38□□□□□ -1.23
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SYN3-211ENST00000472027 UBE2QL1A1L167 161 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LY6LH3BQJ8 138 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C15orf65H3BRN8 121 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 H3BUI4 141 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 J3QR06 171 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 AIPO00170 330 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ORC5O43913 435 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CHST1O43916 411 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GLAP06280 429 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 KIR2DS4P43632 304 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PROK1P58294 105 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP10-3P60369 221 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 QRFPP83859 136 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GAPTQ8N292 157 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR4K15Q8NH41 348 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CYYR1Q96J86 154 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MMP28Q9H239 520 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 KCNK15Q9H427 330 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PSG11Q9UQ72 335 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.37□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 F2RL2O00254 374 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CCRL2O00421 344 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SLC17A2O00624 439 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PDCD6O75340 191 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CA11O75493 328 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 BPNT1O95861 308 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ARSBP15848 533 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CD24P25063 80 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 BRS3P32247 399 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CEACAM3P40198 252 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GNG10P50151 68 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PSMD7P51665 324 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 UNC119Q13432 240 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 P2RY14Q15391 338 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TMEM219Q86XT9 240 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 UBALD1Q8TB05 177 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 NICN1Q9BSH3 213 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TM2D1Q9BX74 207 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 V9GY05 133 aa7.36□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ANK2Q01484 3957 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PPE3 182 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SHISA3A0PJX4 238 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OOSP1A8MZH6 123 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C12orf77C9JDV5 145 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PDCD5O14737 125 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GALP22466 123 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PSMB9P28065 219 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CHATP28329 748 aa7.35□□□□□ -1.23
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