RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MGLL	Q99685	303 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		A6NDX4	124 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		M0QZ24	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM23	O14925	209 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	UBB	P0CG47	229 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	GZMH	P20718	246 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HTR2C	P28335	458 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HES1	Q14469	280 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	P2RY14	Q15391	338 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZTK2	550 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MMP28	Q9H239	520 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		J3QR06	171 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SPINT2	O43291	252 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	UCHL1	P09936	223 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CPE	P16870	476 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	FUT3	P21217	361 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CD34	P28906	385 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TPBG	Q13641	420 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		Q96M66	194 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CITED1	Q99966	193 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	VWF	P04275	2813 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ND4	P03905	459 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	DYNLT3	P51808	116 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MADCAM1	Q13477	382 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SVOP	Q8N4V2	548 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087X0M5	115 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GX30	115 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD6	O75340	191 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CGB3	P0DN86	165 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CGB7	P0DN87	165 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PSMB9	P28065	219 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	REG1B	P48304	166 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FABP5	Q01469	135 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PAX5	Q02548	391 aa		11.89	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.9 ms