RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 RAB18Q9NP72 206 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 DPM3Q9P2X0 92 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC42Q9Y546 428 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 AIPO00170 330 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 GLAP06280 429 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 DYNLT3P51808 116 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 LTC4SQ16873 150 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 OR10K2Q6IF99 312 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 OR9G1Q8NH87 305 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 LINC01006Q8NI28 216 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 RFESDQ8TAC1 157 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC107Q8WV48 283 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 GFI1Q99684 422 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 ETAA1Q9NY74 926 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 LEUTXA8MZ59 168 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 PDCD6O75340 191 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TSPAN9O75954 239 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 BPNT1O95861 308 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 UTF1Q5T230 341 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 FCGR1BQ92637 280 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf95Q9H693 158 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TCF19Q9Y242 345 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 RNF114Q9Y508 228 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 FBN3Q75N90 2809 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 F2RL2O00254 374 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CCRL2O00421 344 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 SLC17A2O00624 439 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CA11O75493 328 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CEACAM3P40198 252 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 UNC119Q13432 240 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 LEAP2Q969E1 77 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 ARL11Q969Q4 196 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 MMP28Q9H239 520 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 KCNK15Q9H427 330 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 PITPNC1Q9UKF7 332 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 A6NDX4 124 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 C15orf65H3BRN8 121 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 ORC5O43913 435 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CHST1O43916 411 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 IGHV3-7P01780 117 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 ARSBP15848 533 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 PSMB9P28065 219 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 PSMD7P51665 324 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 QRFPP83859 136 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 P2RY14Q15391 338 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 RAB11BQ15907 218 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF773Q6PK81 442 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 GAPTQ8N292 157 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TM2D1Q9BX74 207 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 PSG11Q9UQ72 335 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2QL1A1L167 161 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 J3QR06 171 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 GALP22466 123 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGDIBP52566 201 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 OR4C13Q8NGP0 309 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 OR4K15Q8NH41 348 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 SGMS2Q8NHU3 365 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 V9GY05 133 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-206ENST00000470271 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 LY6LH3BQJ8 138 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 CHATP28329 748 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 BRS3P32247 399 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 RANBP1P43487 201 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 GNG10P50151 68 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 PROK1P58294 105 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 C6orf183Q5T699 404 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM219Q86XT9 240 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 UBALD1Q8TB05 177 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 CYYR1Q96J86 154 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-206ENST00000470271 NICN1Q9BSH3 213 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms