RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZSV7 163 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAPTQ8N292 157 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR4F5Q8NH21 305 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDNFQ8TB73 568 aa20.16■□□□□ 0.82
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.14■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHST1O43916 411 aa20.13■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR9G1Q8NH87 305 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARL11Q969Q4 196 aa20.12■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCF19Q9Y242 345 aa20.12■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ORC5O43913 435 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRRX1P54821 245 aa20.11■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 C22orf42Q6IC83 251 aa20.11■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMP28Q9H239 520 aa20.11■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBN3Q75N90 2809 aa20.11■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 C12orf77C9JDV5 145 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CA11O75493 328 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOXL3P58215 753 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.1■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAAP24Q9BTP7 215 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BUI4 141 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 F2RL2O00254 374 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LDLRAD4O15165 306 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMD7P51665 324 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLA2G7Q13093 441 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HES5Q5TA89 166 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LIAT1Q6ZQX7 453 aa20.09■□□□□ 0.81
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