RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TRIP11Q15643 1979 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 C1QAP02745 245 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM204Q9BSN7 226 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 TFPI2P48307 235 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM140Q9NV12 185 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN14O95500 239 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 COL8A1P27658 744 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 SOSTQ9BQB4 213 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 WIPI2Q9Y4P8 454 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 CD1BP29016 333 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 EFNB2P52799 333 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD55Q3KP44 614 aa19.53■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 NEURL2Q9BR09 285 aa19.52■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 MARVELD1Q9BSK0 173 aa19.52■□□□□ 0.72
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF426Q9BUY5 554 aa19.52■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 LOXL3P58215 753 aa19.51■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 SEC11CQ9BY50 192 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 OR4C45A6NMZ5 311 aa19.51■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 RAG2P55895 527 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 BSXQ3C1V8 233 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 OR10C1Q96KK4 312 aa19.51■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 V9GYH0 126 aa19.51■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 SULT1A1P50225 295 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM183BQ1AE95 376 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 PARP11Q9NR21 331 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 CHODLQ9H9P2 273 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 CCL27Q9Y4X3 112 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 FGF11Q92914 225 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 STARD4Q96DR4 205 aa19.5■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 Q9N2K0 584 aa19.5■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF880Q6PDB4 577 aa19.49■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 SCMH1Q96GD3 660 aa19.49■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 ISOC2Q96AB3 205 aa19.49■□□□□ 0.71
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PTPRM-201ENST00000332175 MIXL1Q9H2W2 232 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 CRHP06850 196 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 SFTPCP11686 197 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM255AQ5JRV8 349 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 PGLYRP3Q96LB9 341 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 GPA33Q99795 319 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS50Q9UI38 385 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 PPOXP50336 477 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 PSG4Q00888 419 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-201ENST00000332175 AWAT1Q58HT5 328 aa19.48■□□□□ 0.71
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