RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 UNC119Q13432 240 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 FAM189A2Q15884 450 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 RAB11BQ15907 218 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 LY6EQ16553 131 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 LTC4SQ16873 150 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 RFESDQ8TAC1 157 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF596Q8TC21 504 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC107Q8WV48 283 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 ETAA1Q9NY74 926 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 V9GY05 133 aa20.21■□□□□ 0.83
CXCL2-201ENST00000296031 VGLL3A8MV65 326 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 AIPO00170 330 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 PDCD6O75340 191 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 MDKP21741 143 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 CFPP27918 469 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 HTR1DP28221 377 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 RAG2P55895 527 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 RELBQ01201 579 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR4P4Q8NGL7 312 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.2■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2QL1A1L167 161 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 HAX1O00165 279 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 TOR1AO14656 332 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 PDCD5O14737 125 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 CA11O75493 328 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 IGLV1-47P01700 117 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 MYL9P24844 172 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 UTF1Q5T230 341 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 C22orf42Q6IC83 251 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR10A7Q8NGE5 316 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 PIFOQ8TCI5 191 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 CYYR1Q96J86 154 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 TM2D1Q9BX74 207 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 SHISA3A0PJX4 238 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 NDUFA7O95182 113 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 RANBP1P43487 201 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 PRRX1P54821 245 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 GAPTQ8N292 157 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR4F5Q8NH21 305 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 NICN1Q9BSH3 213 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 DPM3Q9P2X0 92 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 ORC5O43913 435 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3-7P01780 117 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 CHATP28329 748 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 RAB13P51153 203 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 CLDN12P56749 244 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 NEDD8Q15843 81 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR4K15Q8NH41 348 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR9G1Q8NH87 305 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 UBALD1Q8TB05 177 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 LEAP2Q969E1 77 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 ARL11Q969Q4 196 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 STUB1Q9UNE7 303 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 C15orf65H3BRN8 121 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 HES5Q5TA89 166 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 BEX1Q9HBH7 125 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 LEUTXA8MZ59 168 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 TNFAIP8O95379 198 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 RAB3BP20337 219 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 OR10A3P58181 314 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 PSG11Q9UQ72 335 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 MMP24Q9Y5R2 645 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0A6YYD4 124 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1B0GUS0 222 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 POM121CA8CG34 1229 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 CEACAM3P40198 252 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 GNG10P50151 68 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 DYNLT3P51808 116 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 C6orf183Q5T699 404 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZSV7 163 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 C6orf201Q7Z4U5 140 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 FAAP24Q9BTP7 215 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 MMP28Q9H239 520 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 SSR3Q9UNL2 185 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 IFITM5A6NNB3 132 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL2-201ENST00000296031 C12orf77C9JDV5 145 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms