RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 AHRRA9YTQ3 701 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 E5RGE8 158 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN4O14817 238 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PDCD6O75340 191 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 JTBO76095 146 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 DIRAS3O95661 229 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SFTPBP07988 381 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXB5P09067 269 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CTXN2P0C2S0 81 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT3P21217 361 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GLRA1P23415 457 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CHATP28329 748 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ARR3P36575 388 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 UCP3P55916 312 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN15P56746 228 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 S100A10P60903 97 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PLP2Q04941 152 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SWI5Q1ZZU3 235 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 BEX5Q5H9J7 111 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR157Q5UAW9 335 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 AADACL3Q5VUY0 350 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM42Q69YG0 159 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRS11Q6UWP2 260 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GGNQ86UU5 652 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MKXQ8IYA7 352 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GCNT2Q8N0V5 402 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAG16Q8N0X2 631 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SVBPQ8N300 66 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 COMMD1Q8N668 190 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 POC1AQ8NBT0 407 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM171Q8WVE6 324 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM230Q96A57 120 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIN2AQ99865 258 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX7Q9BT81 388 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRG4Q9BZD6 226 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDM14Q9GZV8 571 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PLK3Q9H4B4 646 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP26Q9NRE1 261 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GSKIPQ9P0R6 139 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 NDRG3Q9UGV2 375 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 NSG2Q9Y328 171 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF724A8MTY0 619 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MPTX1A8MV57 137 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 K7EPK0 472 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 LGALS8O00214 317 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SCO1O75880 301 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAPINO95295 136 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CST4P01036 141 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 KNG1P01042 644 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GHRHP01286 108 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 DBHP09172 617 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CD79AP11912 226 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP1P28562 367 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CCKARP32238 428 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PSG4Q00888 419 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFA5Q01523 94 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM27E3Q08E93 113 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 BTN1A1Q13410 526 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAI3Q3KNW1 292 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00596Q86U02 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 LGI3Q8N145 548 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51F2Q8NH61 342 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGCQ92535 297 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SPSB4Q96A44 273 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT14Q96FL9 552 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRG7Q96K78 797 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF75AQ96N20 296 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF126Q9BV68 326 aa5.99□□□□□ -1.45
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