RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Taf9bQ6NZA9 249 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sema6dQ76KF0 1073 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mob3cQ8BJG4 216 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Spata2lQ8BNN1 426 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zbtb49Q8BXX2 756 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ubqln3Q8C5U9 658 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Eddm3bQ8K0E4 149 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Reg4Q9D8G5 157 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ing5Q9D8Y8 240 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tcrg-V5A0A0G2JGV5 113 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cldn34dA2AGU5 210 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ttll3A4Q9E5 927 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Itga5P11688 1053 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bmp8aP34821 399 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Osgin2Q3TEE9 550 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dusp18Q8VE01 188 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1138Q8VFQ9 311 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1038Q8VGS1 319 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ferd3lQ923Z4 168 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dmrtc1c1Q9D410 238 aa15.61■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm13769A2ATW2 309 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm14597A2CFG5 200 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Adh1P00329 375 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm6760Q0ZNK3 87 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 S100a15aQ6S5I3 108 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dact2Q7TN08 757 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Asb5Q9D1A4 329 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc25a22Q9D6M3 323 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 March7Q9WV66 693 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pcnx1Q9QYC1 2344 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ube2dnl2A2AFH2 155 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr936J3KMV2 267 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Efnb2P52800 336 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r183Q8K3N5 305 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tlx3O55144 291 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MgmtP26187 211 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 FauP35545 74 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Atf1P81269 269 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp772Q3UQL6 416 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pld6Q5SWZ9 221 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wdr34Q5U4F6 535 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SetmarQ80UJ9 309 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Actrt3Q8BXF8 369 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Commd5Q8R395 224 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr279Q8VFD8 310 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1377Q8VGH1 307 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nmnat3Q99JR6 245 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fbxw4Q9JMJ2 410 aa15.6■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Prrt2E9PUL5 346 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr740E9PV79 311 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Igh-VJ558P01758 117 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ifna9P09235 190 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lbx1P52955 282 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lcn4Q62472 185 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Shank1D3YZU1 2167 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cacna1iE9Q7P2 2199 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Igkv6-32A0A140T8N9 115 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cdx2P43241 311 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PilrbQ2YFS2 224 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc38a11Q3USY0 453 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr10Q60883 311 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PnkdQ69ZP3 385 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr901Q7TRD1 311 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sh2d7Q8BI17 458 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mrpl48Q8JZS9 211 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnf141Q99MB7 230 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sapcd1Q9CY86 146 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GlceQ9EPS3 618 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hacd1Q9QY80 281 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr608E9Q564 316 aa15.58■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnase2bO35292 155 aa15.58■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cbr1P48758 277 aa15.58■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr32Q7TQZ0 308 aa15.58■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 BmperQ8CJ69 685 aa15.58■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm884A2A9H6 3643 aa15.58■□□□□ 0.09
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1158A2BHP7 313 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wsb1O54927 421 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 McidasQ3UZ45 379 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sox19Q62249 55 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1385Q7TQT1 309 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp955aQ80XR7 545 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vash2Q8C5G2 355 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dctn4Q8CBY8 467 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r89Q8R256 316 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1451Q8VFX5 310 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pla1aQ8VI78 456 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tm4sf5Q91XF2 196 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zdhhc4Q9D6H5 343 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 A0A286YD13 301 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 1700015F17RikD3YUK8 150 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kcng3P59053 433 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MastlQ8C0P0 865 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sulf2Q8CFG0 875 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Carhsp1Q9CR86 148 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mtfp1Q9CRB8 166 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 1700025F22RikQ9D9Y7 111 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tomm20Q9DCC8 145 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms