Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5G2

Vash2, Vasohibin-2, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash2Q8C5G2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Vash2Q8C5G2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Vash2Q8C5G2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vash2Q8C5G2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vash2Q8C5G2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Vash2Q8C5G2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vash2Q8C5G2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vash2Q8C5G2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Vash2Q8C5G2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vash2Q8C5G2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vash2Q8C5G2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vash2Q8C5G2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vash2Q8C5G2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vash2Q8C5G2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Vash2Q8C5G2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vash2Q8C5G2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Vash2Q8C5G2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vash2Q8C5G2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vash2Q8C5G2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vash2Q8C5G2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vash2Q8C5G2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vash2Q8C5G2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vash2Q8C5G2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vash2Q8C5G2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vash2Q8C5G2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vash2Q8C5G2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Vash2Q8C5G2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vash2Q8C5G2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vash2Q8C5G2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Vash2Q8C5G2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vash2Q8C5G2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vash2Q8C5G2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vash2Q8C5G2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vash2Q8C5G2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vash2Q8C5G2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vash2Q8C5G2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vash2Q8C5G2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vash2Q8C5G2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vash2Q8C5G2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vash2Q8C5G2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Vash2Q8C5G2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vash2Q8C5G2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vash2Q8C5G2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vash2Q8C5G2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vash2Q8C5G2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vash2Q8C5G2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vash2Q8C5G2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vash2Q8C5G2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vash2Q8C5G2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vash2Q8C5G2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vash2Q8C5G2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vash2Q8C5G2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vash2Q8C5G2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vash2Q8C5G2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vash2Q8C5G2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vash2Q8C5G2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vash2Q8C5G2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vash2Q8C5G2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vash2Q8C5G2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vash2Q8C5G2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Vash2Q8C5G2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vash2Q8C5G2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vash2Q8C5G2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vash2Q8C5G2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vash2Q8C5G2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vash2Q8C5G2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vash2Q8C5G2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vash2Q8C5G2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vash2Q8C5G2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vash2Q8C5G2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vash2Q8C5G2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vash2Q8C5G2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vash2Q8C5G2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vash2Q8C5G2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vash2Q8C5G2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vash2Q8C5G2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vash2Q8C5G2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vash2Q8C5G2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vash2Q8C5G2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vash2Q8C5G2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vash2Q8C5G2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vash2Q8C5G2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vash2Q8C5G2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vash2Q8C5G2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vash2Q8C5G2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vash2Q8C5G2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vash2Q8C5G2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vash2Q8C5G2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vash2Q8C5G2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vash2Q8C5G2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vash2Q8C5G2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vash2Q8C5G2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vash2Q8C5G2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vash2Q8C5G2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vash2Q8C5G2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vash2Q8C5G2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vash2Q8C5G2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vash2Q8C5G2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vash2Q8C5G2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vash2Q8C5G2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms