RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 CYYR1Q96J86 154 aa13.58□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 FUNDC2Q9BWH2 189 aa13.58□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 A0A1W2PRM7 423 aa13.57□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa13.57□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.57□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 NEDD4LQ96PU5 975 aa13.57□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 ETAA1Q9NY74 926 aa13.57□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 TCF21O43680 179 aa13.56□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 C17orf58Q2M2W7 97 aa13.56□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 SFXN4Q6P4A7 337 aa13.56□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 USP43Q70EL4 1123 aa13.56□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.56□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 DAPK2Q9UIK4 370 aa13.56□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 SESN1Q9Y6P5 492 aa13.56□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.55□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 EFNB2P52799 333 aa13.55□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 TMEM50BP56557 158 aa13.55□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 C6orf201Q7Z4U5 140 aa13.55□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 CCDC107Q8WV48 283 aa13.55□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 DYRK2Q92630 601 aa13.55□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.55□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 A0A0U1RQK1 487 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 CA11O75493 328 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 VENTXO95231 258 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 RAB6AP20340 208 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 GZMHP20718 246 aa13.54□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa13.54□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.54□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 OR56B1Q8NGI3 324 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 PRDM13Q9H4Q3 707 aa13.54□□□□□ -0.24
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IRF1-211ENST00000613424 CALYQ9NYX4 217 aa13.54□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 MEIOCA2RUB1 952 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 SAA4P35542 130 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 HILS1P60008 231 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 VBP1P61758 197 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 IDNKQ5T6J7 187 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 GPR107Q5VW38 600 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 OR52W1Q6IF63 320 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 Q6ZTK2 550 aa13.53□□□□□ -0.24
IRF1-211ENST00000613424 GPR141Q7Z602 305 aa13.53□□□□□ -0.24
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