RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	GDNF	P39905	211 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	TMBIM6	P55061	237 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	DLX6	P56179	175 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM50B	P56557	158 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	BLMH	Q13867	455 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	SETD6	Q8TBK2	473 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	PECR	Q9BY49	303 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	AK3	Q9UIJ7	227 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	MTOR	P42345	2549 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	FUOM	A2VDF0	154 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	DPPA5	A6NC42	116 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	MMP23A	O75900	390 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	CSN2	P05814	226 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF728	P0DKX0	622 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	MMP9	P14780	707 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	HNF1A	P20823	631 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	GATA3	P23771	443 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	SSTR5	P35346	364 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	RORC	P51449	518 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	UTF1	Q5T230	341 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZTK2	550 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	RFESD	Q8TAC1	157 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	RAB3C	Q96E17	227 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF714	Q96N38	554 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	BEX2	Q9BXY8	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	ETV7	Q9Y603	341 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	KPTN	Q9Y664	436 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PPH5	198 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744		M0R1W7	72 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	RAB27B	O00194	218 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	HPGDS	O60760	199 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	CLPX	O76031	633 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-7	P01780	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	MT-ND4	P03905	459 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	PTHLH	P12272	177 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	NFYB	P25208	207 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	RANBP1	P43487	201 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	KCNJ3	P48549	501 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	HCP5	Q6MZN7	132 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZPA2	131 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	PRR18	Q8N4B5	295 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	OR1L1	Q8NH94	360 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	UPRT	Q96BW1	309 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	POM121	Q96HA1	1249 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	CALY	Q9NYX4	217 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF69	Q9UC07	566 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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