RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRB-209ENST00000550857 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-209ENST00000550857 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 OR13C7P0DN81 318 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.96□□□□□ -1.3
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