RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 STARP49675 285 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PRKXP51817 358 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ATP1B3P54709 279 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SLC26A5P58743 744 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ZNF117Q03924 483 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ZP4Q12836 540 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CHAF1BQ13112 559 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R1AQ13522 171 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ACKR1Q16570 336 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ZNF528Q3MIS6 628 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 VASH2Q86V25 355 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PARGQ86W56 976 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SKA3Q8IX90 412 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 OR8K3Q8NH51 312 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ST7LQ8TDW4 575 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 FAM46BQ96A09 425 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 AQP10Q96PS8 301 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PHB2Q99623 299 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SLC6A7Q99884 636 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 NMES1Q9C002 83 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 STRADBQ9C0K7 418 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CST11Q9H112 138 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 FAM60AQ9NP50 221 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 FANCFQ9NPI8 374 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 MMP26Q9NRE1 261 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ASF1BQ9NVP2 202 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 COA4Q9NYJ1 87 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 COMMD9Q9P000 198 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 MBD2Q9UBB5 411 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PISDQ9UG56 409 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 RAB22AQ9UL26 194 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 HHLA2Q9UM44 414 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 OR10H1Q9Y4A9 318 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa3.39□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CEP350Q5VT06 3117 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PNV4 684 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TMEM235A6NFC5 223 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 A6NIZ1 184 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 OR2AT4A6NND4 320 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 A8MVM7 634 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 H7C2Y5 167 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 GPR31O00270 319 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CCSO14618 274 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TSPAN2O60636 221 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ICOSLGO75144 302 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CA11O75493 328 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 SNAPINO95295 136 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ACTL6AO96019 429 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 TNFP01375 233 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 IGLV3-19P01714 112 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CSN3P07498 182 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 DCNP07585 359 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 GLULP15104 373 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 ABOP16442 354 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PGCP20142 388 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CCL1P22362 96 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CRABP1P29762 137 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CBX5P45973 191 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CAPZBP47756 277 aa3.38□□□□□ -1.87
SGCE-211ENST00000522045 CCR4P51679 360 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms