RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 CFAP54Q96N23 3096 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PIEZO1Q92508 2521 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf51A6NDU8 294 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 UMAD1C9J7I0 102 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DOK2O60496 412 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GPANK1O95872 356 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 KNG1P01042 644 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LCATP04180 440 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB1A1P11684 91 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DCTDP32321 178 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MC5RP33032 325 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ALDH3B1P43353 468 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NPY4RP50391 375 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR12D2P58182 307 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOBQ15370 118 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GUSBP1Q15486 140 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TP53I3Q53FA7 332 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 BEX5Q5H9J7 111 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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SMARCE1-211ENST00000493660 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF627Q7L945 461 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NABP1Q96AH0 204 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 APH1AQ96BI3 265 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB39BQ96DA2 213 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PELI1Q96FA3 418 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD6Q9BV23 337 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR35Q9HC97 309 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 UPB1Q9UBR1 384 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MED12LQ86YW9 2145 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DOCK7Q96N67 2140 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GV72 72 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.25□□□□□ -1.41
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SMARCE1-211ENST00000493660 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.25□□□□□ -1.41
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SMARCE1-211ENST00000493660 TRGC2P03986 189 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM87AP0C7U9 286 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CHATP28329 748 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10J1P30954 320 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NTF4P34130 210 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR3A2P47893 321 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SULT1A2P50226 295 aa6.25□□□□□ -1.41
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SMARCE1-211ENST00000493660 PSG3Q16557 428 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MEP1BQ16820 701 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM27BQ5VT28 67 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SYT9Q86SS6 491 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1P1Q8NH06 330 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TRIB1Q96RU8 372 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR32B1ATL7 298 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MPZL1O95297 269 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB6AP20340 208 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GLRA1P23415 457 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H3AP68431 136 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 KLRB1Q12918 225 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ODF1Q14990 250 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TCF24Q7RTU0 167 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.25□□□□□ -1.41
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