RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 Q6ZTK2 550 aa7.38□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 NEK7Q8TDX7 302 aa7.38□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 RAB3CQ96E17 227 aa7.38□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 NICN1Q9BSH3 213 aa7.38□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 CHST6Q9GZX3 395 aa7.38□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.38□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.38□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 PDCD1Q15116 288 aa7.37□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 C6orf183Q5T699 404 aa7.37□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.37□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.37□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 MT-ND4P03905 459 aa7.36□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 GLIPR1P48060 266 aa7.36□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 UPRTQ96BW1 309 aa7.36□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 WDFY2Q96P53 400 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 PECRQ9BY49 303 aa7.36□□□□□ -1.23
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SORCS1-208ENST00000486192 SIRPDQ9H106 197 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 KIF25Q9UIL4 384 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.36□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.35□□□□□ -1.23
SORCS1-208ENST00000486192 UBE2QL1A1L167 161 aa7.35□□□□□ -1.23
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