RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ASCL4Q6XD76 172 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 Q8NFD4 153 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM203Q969S6 136 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf95Q9H693 158 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RAB18Q9NP72 206 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SSR3Q9UNL2 185 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.21□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 VGLL3A8MV65 326 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 M0QZ24 198 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GABRPO00591 440 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 LCE2BO14633 110 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 DEGS1O15121 323 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CHST1O43916 411 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MAS1P04201 325 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF44P15621 663 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CD33P20138 364 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-3P60369 221 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SCN1BQ07699 218 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 NEDD8Q15843 81 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MPV17LQ2QL34 196 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OSR2Q8N2R0 312 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MUL1Q969V5 352 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 IFT22Q9H7X7 185 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RAB9BQ9NP90 201 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 STUB1Q9UNE7 303 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ING4Q9UNL4 249 aa6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JK05 382 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPK0 400 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ODAMA1E959 279 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 HSPB6O14558 160 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM23O14925 209 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PIN1P1O15428 100 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ST8SIA5O15466 376 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CSN2P05814 226 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GLAP06280 429 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CDK2P24941 298 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 LMO1P25800 156 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 HTR2CP28335 458 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GLIPR1P48060 266 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 AESQ08117 197 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RAB11BQ15907 218 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SSX2Q16385 188 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR52W1Q6IF63 320 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 Q6P435 159 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TPRA1Q86W33 373 aa6.19□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.19□□□□□ -1.42
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