RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 COL6A5A8TX70 2615 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 K7N7A8 449 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FCGR3BO75015 233 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CRLF1O75462 422 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SELLP14151 372 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB25P24278 435 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 BMI1P35226 326 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RAB7AP51149 207 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FAM3AP98173 230 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FHL1Q13642 323 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 P2RX4Q99571 388 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TXNDC12O95881 172 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CGAP01215 116 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TFF1P04155 84 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 WNT2P09544 360 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 WNT5AP41221 380 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CCR9P51686 369 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 EFNB3Q15768 340 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MSMO1Q15800 293 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RPEL1Q2QD12 228 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf46Q504U0 113 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TEX30Q5JUR7 227 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35G3Q8N808 338 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RABAC1Q9UI14 185 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GUS0 222 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB11A5LHX3 300 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IQCF6A8MYZ5 107 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RHBDL1O75783 438 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PSG2P11465 335 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GLIPR1P48060 266 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH3B2P48448 385 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RORCP51449 518 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.72□□□□□ -1.814e-10■■■□□ 14.7
PTPRC-201ENST00000348564 PAFAH1B2P68402 229 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 XAF1Q6GPH4 301 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 HMG20AQ9NP66 347 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC182A6NF36 153 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FABP12A6NFH5 140 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 A6NHS1 94 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TNFSF12O43508 249 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CRYZL1O95825 349 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RLN2P04090 185 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 AMY2AP04746 511 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SAA4P35542 130 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GP2P55259 537 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TPPP2P59282 170 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 EFNB1P98172 346 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF561Q8N587 486 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF709Q8N972 641 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR1S1Q8NH92 325 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TSC22D3Q99576 134 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SAP30O75446 220 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1D-33P01593 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-33P01594 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CTXN2P0C2S0 81 aa3.72□□□□□ -1.81
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