RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 SLC17A2O00624 439 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MSTNO14793 375 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 TAAR5O14804 337 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 RAB6AP20340 208 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 COX5AP20674 150 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 IGHV1-2P23083 117 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 G0S2P27469 103 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 IL2RGP31785 369 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PPA1Q15181 289 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 RAB11BQ15907 218 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 FAM166AQ6J272 317 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 RND1Q92730 232 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SPTSSAQ969W0 71 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ATG101Q9BSB4 218 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MEMO1Q9Y316 297 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 A0A096LPE4 126 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 A0A0G2JNJ9 132 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 A0A1W2PPZ6 126 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 EREGO14944 169 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 TSPAN15O95858 294 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MMP16P51512 607 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PSG4Q00888 419 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 POM121Q96HA1 1249 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 Q9UFV3 132 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR6C6A6NF89 314 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 TMEM212A6NML5 194 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SYNGR3O43761 229 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 CST4P01036 141 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 FABP4P15090 132 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 AKR1C4P17516 323 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 HTR2CP28335 458 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PLP2Q04941 152 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 UBE2V2Q15819 145 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 GABRA6Q16445 453 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ZNF529Q6P280 563 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PRR18Q8N4B5 295 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 C4orf45Q96LM5 186 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 HOXC12P31275 282 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 MIDNQ504T8 468 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ZNF774Q6NX45 483 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 R3HDM4Q96D70 268 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 LRRK2Q5S007 2527 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 A8MXE2 369 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 PHOX2AO14813 284 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 LYZL6O75951 148 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 CXCL1P09341 107 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 THBS4P35443 961 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-201ENST00000318129 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms