RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 GNG3P63215 75 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 FABP5Q01469 135 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZNF273Q14593 569 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZFP69Q49AA0 526 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CCDC58Q4VC31 144 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 TRIQKQ629K1 86 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SYS1Q8N2H4 156 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZNF511Q8NB15 262 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ASCL2Q99929 193 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 GON7Q9BXV9 100 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 OR51I2Q9H344 312 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.56□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZNF732B4DXR9 585 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 GABRPO00591 440 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ORC5O43913 435 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SC5DO75845 299 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SPNP16150 400 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZNF3P17036 446 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 MYL9P24844 172 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ACKR3P25106 362 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ATP6V1E1P36543 226 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 TALDO1P37837 337 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 MYCNOSP40205 109 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ACTA2P62736 377 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ACTG2P63267 376 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 BAK1Q16611 211 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PLET1Q6UQ28 207 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CD177Q8N6Q3 437 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ENKURQ8TC29 256 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 AQP3Q92482 292 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 TRIM63Q969Q1 353 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 DIABLOQ9NR28 239 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.55□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 TK1P04183 234 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PGA5P0DJD9 388 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ZNF728P0DKX0 622 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 BRS3P32247 399 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 DLX6P56179 175 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PITPNAQ00169 270 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CDK10Q15131 360 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PYDC2Q56P42 97 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 OSR2Q8N2R0 312 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 Q8N402 240 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 THRSPQ92748 146 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.54□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PSMB11A5LHX3 300 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CTDSPLO15194 276 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ARL6IP5O75915 188 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 H2BFMP0C1H6 154 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 OR2T7P0C7T2 308 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 GSTT2P0CG29 244 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 GSTT2BP0CG30 244 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CELP19835 753 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SLC2A5P22732 501 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CHATP28329 748 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 ARHGDIBP52566 201 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 SCAND1P57086 179 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CD300CQ08708 224 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CNIH2Q6PI25 160 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.53□□□□□ -0.88
SPC25-201ENST00000282074 CPOQ8IVL8 374 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms