RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 Q8WTZ3 238 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 RAB24Q969Q5 203 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CBLN3Q6UW01 205 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 BVESQ8NE79 360 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MISP3Q96FF7 219 aa7.91□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 HNF1AP20823 631 aa7.91□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 M0R143 59 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SEMA7AO75326 666 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM33P57088 247 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 HERVK_113P61574 105 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRB-201ENST00000261266 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 IL19Q9UHD0 177 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PPQ1 181 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRB-201ENST00000261266 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 ISLRO14498 428 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 MT-ND6P03923 174 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 FCARP24071 287 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 PMP22Q01453 160 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 KCNMB1Q16558 191 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 TEPPQ6URK8 271 aa7.89□□□□□ -1.15
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