RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 LEUTXA8MZ59 168 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ICMTO60725 284 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CST4P01036 141 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MC5RP33032 325 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SULT1A1P50225 295 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 AESQ08117 197 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 C12orf73Q69YU5 71 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 VWA1Q6PCB0 445 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PCSK4Q6UW60 755 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR2C3Q8N628 320 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SNX22Q96L94 193 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 GUCD1Q96NT3 240 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR2V2Q96R30 315 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 RNF122Q9H9V4 155 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TCHHQ07283 1943 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV4-34P06331 123 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 IL13RA2Q14627 380 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 DUSP21Q9H596 190 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PILRBQ9UKJ0 227 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PPE3 182 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 C5orf52A6NGY3 159 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FFAR1O14842 300 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 RAB29O14966 203 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SYNGR2O43760 224 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PEX11BO96011 259 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CSN3P07498 182 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 UCP2P55851 309 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 RANP62826 216 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ETFDHQ16134 617 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00596Q86U02 117 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 COMMD1Q8N668 190 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PQF6 199 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FCN1O00602 326 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FAM209AQ5JX71 171 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF738Q8NE65 137 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 LURAP1Q96LR2 239 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 J3QR06 171 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MFNGO00587 321 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MGST3O14880 152 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 IGKV3-15P01624 115 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 HLA-DRB3P79483 266 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 WDR73Q6P4I2 378 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ADRB1P08588 477 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H3AP68431 136 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 JMJD8Q96S16 334 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.23□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 ZG16BQ96DA0 208 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FAM210BQ96KR6 192 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 NTN4Q9HB63 628 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.23□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 IL24Q13007 206 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF154Q13106 437 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 BAK1Q16611 211 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FCARP24071 287 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF137PP52743 207 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SCAND1P57086 179 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 NTN1O95631 604 aa9.23□□□□□ -0.93
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