RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 PALMDQ9NP74 551 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-204ENST00000610404 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-204ENST00000610404 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-204ENST00000610404 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-204ENST00000610404 R4GMQ9 66 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-204ENST00000610404 A0A087X0M5 115 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GX30 115 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OOSP1A8MZH6 123 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FGF16O43320 207 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 E2F6O75461 281 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 LY86O95711 162 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGHV3-7P01780 117 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HMGN1P05114 100 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TMEM11P17152 192 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PRKACAP17612 351 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 POU3F4P49335 361 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FUT6P51993 359 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CXCR4P61073 352 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HES1Q14469 280 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KIR2DS1Q14954 304 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ODF4Q2M2E3 257 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RPEQ96AT9 228 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 COQ2Q96H96 371 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ING3Q9NXR8 418 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ODAMA1E959 279 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 B2RBV5 119 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OR2H2O95918 312 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGKV1D-33P01593 117 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGKV1-33P01594 117 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGKV1D-12P01611 117 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OSMP13725 252 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 NFYBP25208 207 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PTGFRP43088 359 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GPR12P47775 334 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PRRX1P54821 245 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CDC42P60953 191 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FHL3Q13643 280 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TEX38Q6PEX7 206 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SSX6Q7RTT6 188 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 Q8IYB0 196 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OR9G1Q8NH87 305 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 LEAP2Q969E1 77 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ZNF503Q96F45 646 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 BORCS8Q96FH0 119 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CHST5Q9GZS9 411 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HMG20AQ9NP66 347 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GLS2Q9UI32 602 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.82□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 J3QR06 171 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 M0R129 80 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 AP4M1O00189 453 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SYT7O43581 403 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HCKP08631 526 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CGB3P0DN86 165 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CGB7P0DN87 165 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 MS4A2Q01362 244 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GPR50Q13585 617 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 C16orf89Q6UX73 402 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.81□□□□□ -1.32
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