RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF273Q14593 569 aa27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRBOX4Q5JUW0 171 aa27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR141Q7Z602 305 aa27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 COQ2Q96H96 371 aa27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 BARHL1Q9BZE3 327 aa27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM157CP0CG43 387 aa27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFXN4Q6P4A7 337 aa27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBX15Q96SF7 602 aa27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00312Q9Y6C7 94 aa27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 MXRA5Q9NR99 2828 aa27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGFBR1P36897 503 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLIPR1P48060 266 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N7P7 452 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDLRAD4O15165 306 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC2LP0C7M8 214 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGIRRQ6IA17 410 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB12Q6IQ22 244 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 VMO1Q7Z5L0 202 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 LPAR5Q9H1C0 372 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 NF1P21359 2839 aa27.2■■□□□ 1.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL3L1P16619 93 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUT3P21217 361 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCF23Q7RTU1 214 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 ING3Q9NXR8 418 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAPK2Q9UIK4 370 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCOCQ9UIL1 159 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEX16Q9Y5Y5 336 aa27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV40A0A0B4J280 105 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODAMA1E959 279 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCRIP1C9JLW8 97 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL5P46777 297 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRICD5Q6PL45 260 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEK7Q8TDX7 302 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF714Q96N38 554 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NICN1Q9BSH3 213 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPE2 198 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PR64 198 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRV1 198 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDCD6O75340 191 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABARAPO95166 117 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLAP06280 429 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF728P0DKX0 622 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR107Q5VW38 600 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP50Q9UKX7 468 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB22AQ9UL26 194 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0B4J203 849 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCGB2A2Q13296 93 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM89BQ8N5H3 189 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf42Q8N5U0 333 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 CORO2AQ92828 525 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEDD4LQ96PU5 975 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIRT7Q9NRC8 400 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6C3Q9NZP0 311 aa27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL1AP01583 271 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBP4P02753 201 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRTN3P24158 256 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLX6P56179 175 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCS1P62166 190 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR157Q5UAW9 335 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35E4Q6ICL7 350 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF25Q9UIL4 384 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEIKINA0A087WXM9 373 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf98A8MV24 154 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM127O75204 238 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 VBP1P61758 197 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM189A2Q15884 450 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 CROCCP3Q8IVE0 287 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTX4Q96A99 478 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0A6YYD4 124 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB6AP20340 208 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHATP28329 748 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS19P39019 145 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTF1Q16619 201 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 LHX4Q969G2 390 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R3Q9NYW6 316 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHA1P21709 976 aa27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms