RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 IL36GQ9NZH8 169 aa6.37□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 LRRC42Q9Y546 428 aa6.37□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.37□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 C17orf98A8MV24 154 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ARG1P05089 322 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CRYBA1P05813 215 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 LMO1P25800 156 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PSMB9P28065 219 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GABRA5P31644 462 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SAA4P35542 130 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GLIPR1P48060 266 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 Q6P435 159 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ASCL4Q6XD76 172 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 LINC00596Q86U02 117 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PHYHIPQ92561 330 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 FAM46BQ96A09 425 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CST11Q9H112 138 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 BANF2Q9H503 90 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ESM1Q9NQ30 184 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TENM3Q9P273 2699 aa6.36□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PP11 408 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ODAMA1E959 279 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SC5DO75845 299 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CLPXO76031 633 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MPIG6BO95866 241 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RBP4P02753 201 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CSN2P05814 226 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MELTFP08582 738 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 UCHL1P09936 223 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 UBBP0CG47 229 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MGMTP16455 207 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MYL9P24844 172 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 HTR2CP28335 458 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GLP1RP43220 463 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RANBP1P43487 201 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 KCNJ3P48549 501 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 FABP5Q01469 135 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TAF9Q16594 264 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MPV17LQ2QL34 196 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 OR52W1Q6IF63 320 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 BRICD5Q6PL45 260 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TREML4Q6UXN2 200 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 Q6YL49 198 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SPARTQ8N0X7 666 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 NDNFQ8TB73 568 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 FCGR1BQ92637 280 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TNFRSF14Q92956 283 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 GHRLQ9UBU3 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 KIF25Q9UIL4 384 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RYR1P21817 5038 aa6.35□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 FAM172BPA6NC97 362 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 H3BUI4 141 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CCRL2O00421 344 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 TOR1AO14656 332 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PDCD5O14737 125 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 IGHV4-59P01825 116 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 OMGP23515 440 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 CDK2P24941 298 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 NFYBP25208 207 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 DLX6P56179 175 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 NEDD8Q15843 81 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 RAB12Q6IQ22 244 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 C16orf87Q6PH81 154 aa6.34□□□□□ -1.39
SMG6-211ENST00000572369 ZNF773Q6PK81 442 aa6.34□□□□□ -1.39
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