RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PPA2Q9H2U2 334 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 MEIOCA2RUB1 952 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 ANGPTL7O43827 346 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 SRMP19623 302 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 KIR2DS4P43632 304 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 OR10A3P58181 314 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 UTS2BQ765I0 119 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 SPSB1Q96BD6 273 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF222Q9UK12 451 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PRF3 423 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 M0R1W7 72 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 PDCD5O14737 125 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB3O15480 346 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 SULT1B1O43704 296 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 PRKACAP17612 351 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 RAB3BP20337 219 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 SDSLQ96GA7 329 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 OR4F4Q96R69 305 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 GPER1Q99527 375 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 TMEM225BP0DP42 221 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 GABRR1P24046 479 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 DUSP1P28562 367 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 BDKRB2P30411 391 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 SAA4P35542 130 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 NPBWR2P48146 333 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 EFNB2P52799 333 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 DLX1P56177 255 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 ERVK11-1P61568 191 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 EDDM3AQ14507 147 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-210ENST00000442481 RNF144BQ7Z419 303 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 TPRA1Q86W33 373 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 Q8IYB0 196 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 CFHR4Q92496 578 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 HES4Q9HCC6 221 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPH5 198 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 H3BUX3 64 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 SIRPB1O00241 398 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-210ENST00000442481 PEX14O75381 377 aa9.49□□□□□ -0.89
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