RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST4Q8NCG5 386 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5D18Q8NGL1 313 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYDC1Q8WXC3 89 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIRREL1Q96J84 757 aa10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPI3 338 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINE3A8MV23 424 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF16O43320 207 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCM2P0CE71 109 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM11P17152 192 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35B1P78383 322 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF85Q03923 595 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN1BQ07699 218 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM4DQ6B0I6 523 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6P435 159 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGGYQ96C11 551 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPACA5Q96QH8 159 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBOAT4Q96T53 435 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOFQ9HBH0 211 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENOPH1Q9UHY7 261 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 U3KQK5 164 aa10.4□□□□□ -0.74
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RYR2Q92736 4967 aa10.4□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1E1P36543 226 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLP1RP43220 463 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HES1Q14469 280 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF695Q8IW36 515 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMMD1Q8N668 190 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRAM1Q8N682 238 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13C9Q8NGT0 318 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2G2Q8NGZ5 317 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFAP2CQ92754 450 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCX3BQ9H321 246 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEK6Q9HC98 313 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SACSQ9NZJ4 4579 aa10.39□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G3V2T6 193 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BNX3 289 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3QR06 171 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAMP3O60896 148 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHG2P01859 326 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-ND2P03891 347 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISG15P05161 165 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CGB3P0DN86 165 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CGB7P0DN87 165 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMED1Q13445 227 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6AP1Q15904 470 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAXO1Q8IYX7 474 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STPG2Q8N412 459 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51T1Q8NGJ9 327 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRG4Q8WWG1 115 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX3Q96PT4 197 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALYQ9NYX4 217 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC42Q9Y546 428 aa10.38□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEGS1O15121 323 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL1AP01583 271 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1D-33P01593 117 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-33P01594 117 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-7P01780 117 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB7AP51149 207 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB25P57735 213 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MADCAM1Q13477 382 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK5R1Q15078 307 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8H3Q8N146 312 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEAP2Q969E1 77 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EME1Q96AY2 570 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAX2Q96IS3 184 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIB1Q99828 191 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSG11Q9UQ72 335 aa10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0YJX3 145 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL24O00175 119 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPB6O14558 160 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LUMP51884 338 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZP1P60852 638 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNF4GQ14541 408 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FDX2Q6P4F2 183 aa10.36□□□□□ -0.75
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.9 ms