RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C PIG2P40187 538 aa2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C BIT61P47041 543 aa2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C VPS34P22543 875 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C MGS1P40151 587 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C KHA1P40309 873 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C MPS3P47069 682 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C MET13P53128 600 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SNF12P53628 566 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SEG1Q04279 960 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C VPS36Q06696 566 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C OSW1Q08692 278 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C POM34Q12445 299 aa2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C NOP14Q99207 810 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C PHO5P00635 467 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C ABF1P14164 731 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C IME1P21190 360 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C KCC4P25389 1037 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C PET127P32606 800 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YHR202WP38887 602 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C RFX1P48743 811 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C DNM1P54861 757 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C TFB2Q02939 513 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YFT2Q06676 274 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YDL086WQ07505 273 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C DOT6P40059 670 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C BNA3P47039 444 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YJR142WP47173 342 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C COX18P53239 316 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C IZH3Q07959 543 aa2.43□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C FRS1P15624 595 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SFP1P32432 683 aa2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C MAL31P38156 614 aa2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C LTP1P40347 161 aa2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YNL193WP53870 558 aa2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C RKI1Q12189 258 aa2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YGR161W-CQ3E744 92 aa2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C ADR1P07248 1323 aa2.42□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C IMG2P25642 146 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YKU70P32807 602 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C COS111P38308 924 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YIL077CP40508 320 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C RIM13Q03792 727 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C HFD1Q04458 532 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C VHS3Q08438 674 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SLK19Q08581 821 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C LAM4P38800 1345 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SWI6P09959 803 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C KIN82P25341 720 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YMC1P32331 307 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YDR179W-AQ03983 463 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YPS7Q06325 596 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C GUD1Q07729 489 aa2.41□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C NTH1P32356 751 aa2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C UGP1P32861 499 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C APL3P38065 1025 aa2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C NMA2P53204 395 aa2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SPC98P53540 846 aa2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C ARG7Q04728 441 aa2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YLR407WQ06070 228 aa2.4□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C STE4P18851 423 aa2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C MBR1P23493 339 aa2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C BUD8P41698 603 aa2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RET2P43621 546 aa2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C HLJ1P48353 224 aa2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YGL117WP53133 265 aa2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C UFO1Q04511 668 aa2.4□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PGK1P00560 416 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C TPK2P06245 380 aa2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C CCT5P40413 562 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PMT6P42934 759 aa2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C DIP5P53388 608 aa2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C STP4Q07351 490 aa2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C ULA1Q12059 462 aa2.39□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C STE12P13574 688 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C GAT1P43574 510 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C IES1P43579 692 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C HLR1Q04429 423 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PTP1P25044 335 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YUR1P26725 428 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PRE4P30657 266 aa2.38□□□□□ -2.03
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