RNA–Protein interactions for RNA: YMR082C

YMR082C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YMR082C, Length 357 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR082C	YMR082C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PSF3	Q12146	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ISA2	Q12425	185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CDC16	P09798	840 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CNS1	P33313	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	APM3	P38153	483 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	GIP4	P39732	760 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YEL068C	P39977	110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	TOK1	P40310	691 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SAE2	P46946	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YAP1802	P53309	568 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CBK1	P53894	756 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YLH47	Q06493	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YPL260W	Q08977	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	NUR1	Q12066	484 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	DNA2	P38859	1522 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	QCR6	P00127	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	BI4	P03879	638 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CKA1	P15790	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	MLS1	P30952	554 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ORC2	P32833	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	MDL1	P33310	695 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	OAF3	P36023	863 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ALG3	P38179	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PNT1	P38969	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YJL068C	P40363	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	VID22	Q05934	901 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
YMR082C	YMR082C	GCN4	P03069	281 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	MET8	P15807	274 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PER1	P25625	357 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	FLR1	P38124	548 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	HXT7	P39004	570 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PIK1	P39104	1066 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PSF2	P40359	213 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ALY2	P47029	1046 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YJL045W	P47052	634 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	HST1	P53685	503 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SEC5	P89102	971 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	RMT2	Q03305	412 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YDL073W	Q07454	984 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ENV7	Q12003	364 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	APL4	Q12028	832 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	NBP2	Q12163	236 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PTC5	Q12511	572 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SAC3	P46674	1301 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PUP2	P32379	260 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	MTH1	P35198	433 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	FTH1	P38310	465 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YLF2	P38746	405 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	SPT8	P38915	602 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YER010C	P40011	234 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	YIL092W	P40497	633 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
YMR082C	YMR082C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR082C	YMR082C	PHO5	P00635	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	SGF29	P25554	259 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	SEC65	P29478	273 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	CBF2	P32504	956 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	IME2	P32581	645 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	AIM26	P32858	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	TGL1	P34163	548 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR082C	YMR082C	YBR225W	P38321	900 aa		5.02	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.3 ms