RNA–Protein interactions for RNA: YFL036W

RPO41, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase, yeast

Gene RPO41, Length 4,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO41	YFL036W	RTP1	Q12751	981 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	LSO1	Q3E827	93 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	WHI2	P12611	486 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	POL3	P15436	1097 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
RPO41	YFL036W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	KAP122	P32767	1081 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MRPL7	P36519	292 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PSY4	P38193	441 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CCC2	P38995	1004 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PPT1	P53043	513 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HDA1	P53973	706 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ADY4	Q05955	493 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	IES4	Q08561	116 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	POX1	P13711	748 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ACE2	P21192	770 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TSR4	P25040	408 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YME1	P32795	747 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	EFM4	P40516	257 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YJR054W	P47114	497 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	NNF1	P47149	201 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YGR111W	P53265	400 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HED1	Q03937	162 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	VTI1	Q04338	217 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	AEP2	P22136	580 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	IRE1	P32361	1115 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PEX5	P35056	612 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	JNM1	P36224	373 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PIH1	P38768	344 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	KAP114	P53067	1004 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SLD5	Q03406	294 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	FMP25	Q08023	583 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	FBP1	P09201	348 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ADH4	P10127	382 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	UBP11	P36026	717 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	POA1	P38218	177 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YJR107W	P47145	328 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HFM1	P51979	1187 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RTA1	P53047	317 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PEX31	P53203	462 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	YNL011C	P53980	444 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MSC2	Q03455	724 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	GRX8	Q05926	109 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	HOS1	Q12214	470 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DBF4	P32325	704 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PPX1	P38698	397 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	NEO1	P40527	1151 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	LAM5	P43560	674 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	EAR1	Q03212	550 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ECI1	Q05871	280 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	JIP3	O13555	125 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	STE6	P12866	1290 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PUT4	P15380	627 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SPO16	P17122	198 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	PSO2	P30620	661 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CIN4	P39110	191 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SPO74	P45819	413 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	NGL3	Q03210	505 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SND1	Q04007	877 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	STE23	Q06010	1027 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	VHS3	Q08438	674 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TMA16	Q08687	178 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MOT1	P32333	1867 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	CLN2	P20438	545 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SEC65	P29478	273 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	TMT1	P32643	299 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	SET3	P36124	751 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	DYS1	P38791	387 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	MND2	P40577	368 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	LSC2	P53312	427 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPO41	YFL036W	IVY1	Q04934	453 aa		2.75	□□□□□ -1.97

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