RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	CHST3	Q7LGC8	479 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	EXOC4	Q96A65	974 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1W2PQ27	194 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1W2PQ64	194 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1W2PQD8	194 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	NRDC	O43847	1150 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	UBASH3A	P57075	661 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PLP1-223	ENST00000621218	MAP2K7	O14733	419 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ACTN2	P35609	894 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	GNG11	P61952	73 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	INTS13	Q9NVM9	706 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	CCP110	O43303	1012 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	HOXC9	P31274	260 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	TEF	Q10587	303 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	DHX58	Q96C10	678 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	VSTM4	Q8IW00	320 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	GRM8	O00222	908 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	IKBKB	O14920	756 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	SERPINC1	P01008	464 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	AK7	Q96M32	723 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	STK38	Q15208	465 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	NCAPD2	Q15021	1401 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	SPTLC2	O15270	562 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PFKFB1	P16118	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	VPS18	Q9P253	973 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ARHGAP6	O43182	974 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	HOXB7	P09629	217 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	TXLNA	P40222	546 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	MCM6	Q14566	821 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218		A0A0U1RQJ8	604 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	KIF28P	B7ZC32	967 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	MLEC	Q14165	292 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	ATP5J	P18859	108 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	UTY	O14607	1347 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	BTBD11	A6QL63	1104 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	CDC27	P30260	824 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	NLRP6	P59044	892 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	PNOC	Q13519	176 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	TC2N	Q8N9U0	490 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PLP1-223	ENST00000621218	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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