RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LAMA4Q16363 1823 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADD2P35612 726 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BICD2Q8TD16 824 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PGBD1Q96JS3 809 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF213O14771 459 aa25.57■■□□□ 1.68
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.57■■□□□ 1.68
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLIT2O94813 1529 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SIK1P57059 783 aa25.56■■□□□ 1.68
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UVSSAQ2YD98 709 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC12Q96J65 1359 aa25.56■■□□□ 1.68
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP3K11Q16584 847 aa25.55■■□□□ 1.68
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NR1I2O75469 434 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADCY5O95622 1261 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MCM5P33992 734 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANTXR2P58335 489 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LPIN2Q92539 896 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNMDQ9H2S6 317 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC192P0DO97 292 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCOA7Q8NI08 942 aa25.54■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UQCRHP07919 91 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF3AQ9Y496 699 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDE6AP16499 860 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CAMTA2O94983 1202 aa25.52■■□□□ 1.68
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF3Q9H094 633 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFAP45Q9UL16 551 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUP98P52948 1817 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNQ2O43526 872 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FGFR2P21802 821 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM4AO75164 1064 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC5A1P13866 664 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TYRO3Q06418 890 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE3CQ15386 1083 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA5Q8NB90 893 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP28Q96RU2 1077 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EVCP57679 992 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RASGRF1Q13972 1273 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AP5Z1O43299 807 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXL16Q8N461 479 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AIDAQ96BJ3 306 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNQ4P56696 695 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRDNQ13061 729 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INCENPQ9NQS7 918 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.47■■□□□ 1.67
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