RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PICALMQ13492 652 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 GNPTABQ3T906 1256 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SP8Q8IXZ3 490 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CFAP45Q9UL16 551 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 NLRX1Q86UT6 975 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 BCAR3O75815 825 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 USP17L8P0C7I0 530 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PANK1Q8TE04 598 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MCM5P33992 734 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CIAO1O76071 339 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 WTAPQ15007 396 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CALML4Q96GE6 196 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 GPR108Q9NPR9 543 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 FBXO40Q9UH90 709 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 KDRP35968 1356 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 COL15A1P39059 1388 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 A1BGP04217 495 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 KCTD2Q14681 263 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 STK38Q15208 465 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 TSG101Q99816 390 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 DEPDC5O75140 1603 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 GOLIM4O00461 696 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 DNM2P50570 870 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 NLRP5P59047 1200 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PIGBQ92521 554 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC102AQ96A19 550 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 KIF1AQ12756 1690 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CETN2P41208 172 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC45Q96CN5 670 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MYO6Q9UM54 1294 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 STX8Q9UNK0 236 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 USP40Q9NVE5 1235 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 AOX1Q06278 1338 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 CEP152O94986 1710 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 YY1P25490 414 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 SYNE4Q8N205 404 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 MST1RQ04912 1400 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 ABCD1P33897 745 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 GTF2IP78347 998 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 FAM89AQ96GI7 184 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 AZI2Q9H6S1 392 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 PIK3C2BO00750 1634 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-212ENST00000591126 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms