RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 APAF1O14727 1248 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRS-208ENST00000590509 CASP7P55210 303 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRS-208ENST00000590509 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRS-208ENST00000590509 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 TAF5LO75529 589 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 ITGA6P23229 1130 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 DLGAP5Q15398 846 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 INHBEP58166 350 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CHRNDQ07001 517 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 GNAI1P63096 354 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CFAP100Q494V2 611 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 ERO1AQ96HE7 468 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 EFCC1Q9HA90 598 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 VEZTQ9HBM0 779 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CSF1RP07333 972 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 SPDYE6P0CI01 402 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 SP3Q02447 781 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF333Q96JL9 665 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 ELP3Q9H9T3 547 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 SZT2Q5T011 3432 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 RASA3Q14644 834 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 MMP14P50281 582 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 GCKRQ14397 625 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRS-208ENST00000590509 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 OPTNQ96CV9 577 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 IL1R1P14778 569 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 KCNJ4P48050 445 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 TEPSINQ96N21 525 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 OTUD5Q96G74 571 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 H0YGN5 161 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 FOXO4P98177 505 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 GRIK5Q16478 980 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 SLC4A2P04920 1241 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRS-208ENST00000590509 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 UNCXA6NJT0 531 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 VGLL4Q14135 290 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CCL15Q16663 113 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 MYO1BO43795 1136 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 PLIN1O60240 522 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CTGFP29279 349 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 SHISA4Q96DD7 197 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 FLIIQ13045 1269 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 MTFR1Q15390 333 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 STK31Q9BXU1 1019 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 GYG1P46976 350 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CACNB3P54284 484 aa20.47■□□□□ 0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms