RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 PHLPP1O60346 1717 aa27.27■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 MCM5P33992 734 aa27.27■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 FOSBP53539 338 aa27.27■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 DDB1Q16531 1140 aa27.27■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.27■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.26■■□□□ 1.96
EHD4-202ENST00000569223 CCDC192P0DO97 292 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 PHKA1P46020 1223 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K11Q16584 847 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 SUSD4Q5VX71 490 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CCDC102BQ68D86 513 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 DACT1Q9NYF0 836 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CFAP45Q9UL16 551 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 PRC1O43663 620 aa27.25■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ADAMTS2O95450 1211 aa27.25■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.25■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 FGFR2P21802 821 aa27.25■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 LPIN2Q92539 896 aa27.25■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 A0A0G2JS52 829 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 NCOA7Q8NI08 942 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ZNF213O14771 459 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ATP6V1AP38606 617 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ANTXR2P58335 489 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 UBE3CQ15386 1083 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CAMK4Q16566 473 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 KDM4AO75164 1064 aa27.23■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ADCY5O95622 1261 aa27.23■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CLSTN2Q9H4D0 955 aa27.23■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 BICD2Q8TD16 824 aa27.23■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 TNMDQ9H2S6 317 aa27.23■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.22■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.22■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 PPFIA3O75145 1194 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 PDE6AP16499 860 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 NBPF3Q9H094 633 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 DOCK2Q92608 1830 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 LAMB2P55268 1798 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 OFD1O75665 1012 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 CAMTA2O94983 1202 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 SIK1P57059 783 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 ITPK1Q13572 414 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD4-202ENST00000569223 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 FAM177BA6PVY3 158 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 NR1I2O75469 434 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 TYRO3Q06418 890 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 SLC5A1P13866 664 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 PARP10Q53GL7 1025 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 CKAP2LQ8IYA6 745 aa27.19■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 C4AP0C0L4 1744 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 C4BP0C0L5 1744 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 GUCY1B3Q02153 619 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 ATL3Q6DD88 541 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D10CQ8IV04 446 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 SPATA5Q8NB90 893 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 FAM200AQ8TCP9 573 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 USP28Q96RU2 1077 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 AP5Z1O43299 807 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 NTSR2O95665 410 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 APPP05067 770 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 TRDNQ13061 729 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD4-202ENST00000569223 RTL9Q8NET4 1388 aa27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms