RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	HACL1	Q9UJ83	578 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	XAGE2	Q96GT9	111 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	FZD1	Q9UP38	647 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	UBE4A	Q14139	1066 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	COA1	Q9GZY4	146 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	BRCA2	P51587	3418 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	C1QTNF8	P60827	252 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	PODN	Q7Z5L7	613 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC102B	Q68D86	513 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR90	Q96KV7	1748 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	CIAO1	O76071	339 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	TNIP1	Q15025	636 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	SKAP1	Q86WV1	359 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	LPIN2	Q92539	896 aa		12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	TOMM70	O94826	608 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	CHGB	P05060	677 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC5A1	P13866	664 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	PRDX5	P30044	214 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	CACNB3	P54284	484 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	CLRN2	A0PK11	232 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	ADM5	C9JUS6	153 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHD	P01880	384 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	MS4A1	P11836	297 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	IL1R1	P14778	569 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	RASGRF1	Q13972	1273 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	TNNI3K	Q59H18	835 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	GML	Q99445	158 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	AACS	Q86V21	672 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	ABCF2	Q9UG63	623 aa		12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	USP17L8	P0C7I0	530 aa		12.46	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	NBR1	Q14596	966 aa		12.46	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	GORAB	Q5T7V8	394 aa		12.46	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		12.46	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		12.46	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	VPS33B	Q9H267	617 aa		12.46	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		12.46	□□□□□ -0.41
FAM227B-208	ENST00000559573		H7C1D1	291 aa		12.46	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	MCAM	P43121	646 aa		12.46	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		12.46	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.46	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	CNTROB	Q8N137	903 aa		12.46	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		12.46	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF609	O15014	1411 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	SLURP2	P0DP57	97 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	USP48	Q86UV5	1035 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	GGA3	Q9NZ52	723 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	SCN4A	P35499	1836 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	GRM1	Q13255	1194 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	PRKG1	Q13976	671 aa		12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	PSME4	Q14997	1843 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	WNT10B	O00744	389 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	MOB2	Q70IA6	237 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		12.44	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF384	Q8TF68	577 aa		12.43	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
FAM227B-208	ENST00000559573	ZAP70	P43403	619 aa		12.43	□□□□□ -0.42

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