RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 KCTD2Q14681 263 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 AAK1Q2M2I8 961 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 TMC4Q7Z404 712 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 OPTNQ96CV9 577 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 EYA3Q99504 573 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 USP16Q9Y5T5 823 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 SCN9AQ15858 1988 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 C6orf229H3BNL8 230 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 POLLQ9UGP5 575 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 SUSD4Q5VX71 490 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 PHOX2BQ99453 314 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 CFAP54Q96N23 3096 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-225ENST00000551253 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ELNP15502 786 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 GRAPQ13588 217 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ZNF576Q9H609 170 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 GABRQQ9UN88 632 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 PFASO15067 1338 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 G3V3G9 751 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 FCGRTP55899 365 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 OGFOD1Q8N543 542 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 UIMC1Q96RL1 719 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ELP3Q9H9T3 547 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 CPA4Q9UI42 421 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 USP34Q70CQ2 3546 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 NTSR2O95665 410 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 KCNQ1P51787 676 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 IRF5Q13568 498 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 PODNQ7Z5L7 613 aa9.5□□□□□ -0.89
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CS-225ENST00000551253 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 BTBD19C9JJ37 291 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 COL6A1P12109 1028 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 GPTP24298 496 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 FLT3LGP49771 235 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 MMP14P50281 582 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 TFF2Q03403 129 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ATRXP46100 2492 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 SASH1O94885 1247 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 CETPP11597 493 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 GPSM2P81274 684 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 USP17L3A6NCW0 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 USP17L4A6NCW7 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 DNAJB2P25686 324 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 PANK3Q9H999 370 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-225ENST00000551253 TLL1O43897 1013 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 GFRA3O60609 400 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 TEFQ10587 303 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 NUP98P52948 1817 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 PSME4Q14997 1843 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-225ENST00000551253 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.45□□□□□ -0.9
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