RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 PAOXQ6QHF9 649 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 OGFOD1Q8N543 542 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 OR13H1Q8NG92 308 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 WNT8BQ93098 351 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRQ-204ENST00000549355 KRT1P04264 644 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 FUT4P22083 530 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 PIP4K2BP78356 416 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 C20orf173Q96LM9 149 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 TOPBP1Q92547 1522 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 NLRP12P59046 1061 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 CSRNP1Q96S65 589 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF4AO95239 1232 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 BNIP3Q12983 259 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 NLRP13Q86W25 1043 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 MYO19Q96H55 970 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 WDR97A6NE52 1622 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L3A6NCW0 530 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L4A6NCW7 530 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 H3BRJ5 948 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 INHBBP09529 407 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 IGFBP4P22692 258 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 PRDM2Q13029 1718 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 DLGAP3O95886 979 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP10-2P60368 255 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 HGSNATQ68CP4 663 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 PBX4Q9BYU1 374 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 SOGA1O94964 1423 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRQ-204ENST00000549355 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 CD8BP10966 210 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 DRD2P14416 443 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 CTSWP56202 376 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 HYAL2Q12891 473 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 TREML1Q86YW5 311 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 CEP120Q8N960 986 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 PTPRAP18433 802 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 MLANAQ16655 118 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 MISP3Q96FF7 219 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 LGR5O75473 907 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 C1QTNF9P0C862 333 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 HOXA5P20719 270 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 SEC13P55735 322 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 CYP27A1Q02318 531 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 SPACA7Q96KW9 195 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRQ-204ENST00000549355 USP11P51784 963 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 GRIN2BQ13224 1484 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 NFKBIEO00221 500 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 UCN2Q96RP3 112 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 CD96P40200 585 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms