RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 USP44Q9H0E7 712 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ADCY9O60503 1353 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 RGS3P49796 1198 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PICALMQ13492 652 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TEKT1Q969V4 418 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TIMM10P62072 90 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TFCP2Q12800 502 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 LRRC24Q50LG9 513 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 GPC2Q8N158 579 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CLRN2A0PK11 232 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 FSD1Q9BTV5 496 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PSMD14O00487 310 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TOMM70O94826 608 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PDE8BO95263 885 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ATP2B2Q01814 1243 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CXCL9Q07325 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 HOOK2Q96ED9 719 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 A0A1B0GUL7 405 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TNNQ9UQP3 1299 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SNAP23O00161 211 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 RAB11FIP3O75154 756 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 BCAMP50895 628 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ATP8B2P98198 1209 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 NFKBIEO00221 500 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SASH1O94885 1247 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 HLA-DOAP06340 250 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CHADLQ6NUI6 762 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CD209Q9NNX6 404 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CSADQ9Y600 493 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CRY2Q49AN0 593 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 USP48Q86UV5 1035 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 LNPKQ9C0E8 428 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ITGB4P16144 1822 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TCP10Q12799 353 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 XAGE2Q96GT9 111 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 VPS33BQ9H267 617 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 POLLQ9UGP5 575 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CYP7A1P22680 504 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 EPS15P42566 896 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ECE1P42892 770 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CNTROBQ8N137 903 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM63Q969Q1 353 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 FEZ1Q99689 392 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 GGA3Q9NZ52 723 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF521Q96K83 1311 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 PLCG2P16885 1265 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 LDHDQ86WU2 507 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 GOLIM4O00461 696 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 HUNKP57058 714 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-206ENST00000548122 CFAP100Q494V2 611 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms