RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533078.5

CMTM1-216, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-216ENST00000533078 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 MAP3K11Q16584 847 aa14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 WNK4Q96J92 1243 aa14.72□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 BRCA2P51587 3418 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 F8W031 263 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CMTM1-216ENST00000533078 KLRK1P26718 216 aa14.71□□□□□ -0.05
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CMTM1-216ENST00000533078 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 SPDYE6P0CI01 402 aa14.69□□□□□ -0.06
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CMTM1-216ENST00000533078 TAF5LO75529 589 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 CCDC27Q2M243 656 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 G2E3Q7L622 706 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.68□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 IL1R1P14778 569 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 SP3Q02447 781 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 CRHR2Q13324 411 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 NBPF11Q86T75 865 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 CERS5Q8N5B7 392 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.67□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 IL16Q14005 1332 aa14.66□□□□□ -0.06
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CMTM1-216ENST00000533078 TNNI2P48788 182 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 RASA3Q14644 834 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.66□□□□□ -0.06
CMTM1-216ENST00000533078 WWC1Q8IX03 1113 aa14.66□□□□□ -0.06
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CMTM1-216ENST00000533078 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 VPS37DQ86XT2 251 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 ELP3Q9H9T3 547 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.64□□□□□ -0.07
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CMTM1-216ENST00000533078 JAG2Q9Y219 1238 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 LAMB1P07942 1786 aa14.64□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 GTF2A2P52657 109 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.63□□□□□ -0.07
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CMTM1-216ENST00000533078 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.63□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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CMTM1-216ENST00000533078 KIF22Q14807 665 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.62□□□□□ -0.07
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CMTM1-216ENST00000533078 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.62□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 A0A1B0GUL6 1792 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 GRM8O00222 908 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 UBE4AQ14139 1066 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 CCL15Q16663 113 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM1-216ENST00000533078 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.6□□□□□ -0.07
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