RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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ACER3-204ENST00000525861 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
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ACER3-204ENST00000525861 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.65■■■□□ 2.02
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ACER3-204ENST00000525861 LARGE1O95461 756 aa27.62■■■□□ 2.01
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ACER3-204ENST00000525861 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.61■■■□□ 2.01
ACER3-204ENST00000525861 MCM4P33991 863 aa27.6■■■□□ 2.01
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ACER3-204ENST00000525861 GPSM2P81274 684 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-204ENST00000525861 ME3Q16798 604 aa27.6■■■□□ 2.01
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ACER3-204ENST00000525861 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
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ACER3-204ENST00000525861 CYP7A1P22680 504 aa27.58■■■□□ 2.01
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ACER3-204ENST00000525861 GBP4Q96PP9 640 aa27.58■■■□□ 2.01
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ACER3-204ENST00000525861 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
ACER3-204ENST00000525861 ZNF213O14771 459 aa27.57■■■□□ 2
ACER3-204ENST00000525861 APPP05067 770 aa27.57■■■□□ 2
ACER3-204ENST00000525861 GNAT2P19087 354 aa27.57■■■□□ 2
ACER3-204ENST00000525861 ARMT1Q9H993 441 aa27.57■■■□□ 2
ACER3-204ENST00000525861 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.57■■■□□ 2
ACER3-204ENST00000525861 SRGNP10124 158 aa27.56■■■□□ 2
ACER3-204ENST00000525861 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
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