RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 CCNJLQ8IV13 435 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 EHD4Q9H223 541 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 NLRP12P59046 1061 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 ACAD11Q709F0 780 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 WNT8BQ93098 351 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 A0A096LPE4 126 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PPZ6 126 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 TREHO43280 583 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 ADAM23O75077 832 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 DSC3Q14574 896 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 TP53INP1Q96A56 240 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 ARL4DP49703 201 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 PI16Q6UXB8 463 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 PLCB3Q01970 1234 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ASB16Q96NS5 453 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 GLB1P16278 677 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 MAPK8P45983 427 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 GRM2Q14416 872 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 PCDH1Q08174 1060 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ABCB6Q9NP58 842 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 DYRK3O43781 588 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 GSTM4Q03013 218 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZS46 218 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 HOMEZQ8IX15 550 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 SETDB2Q96T68 719 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 USP26Q9BXU7 913 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF576Q9H609 170 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ITPKAP23677 461 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 ITGB7P26010 798 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-215ENST00000506510 BCO2Q9BYV7 579 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 FCGRTP55899 365 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 CEP41Q9BYV8 373 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 RNF208Q9H0X6 261 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 DLGAP3O95886 979 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 B3GALT4O96024 378 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 FAAP100Q0VG06 881 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 MAOBP27338 520 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 ATP2B2Q01814 1243 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 FDX2Q6P4F2 183 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 FBF1Q8TES7 1133 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 ECEL1O95672 775 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 CTSBP07858 339 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 PREPP48147 710 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.47□□□□□ -1.05
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