RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 RASIP1Q5U651 963 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 KANK3Q6NY19 840 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ZNF576Q9H609 170 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TTLL8A6PVC2 850 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 NFKBIEO00221 500 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 THBS1P07996 1170 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 FAM157BP0CG42 384 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PGBD3Q8N328 593 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 CEP120Q8N960 986 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 APPBP2Q92624 585 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 FAM221AA4D161 298 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PDPK1O15530 556 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TRIM37O94972 964 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 F11P03951 625 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PSAPP07602 524 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 SOX18P35713 384 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 AMPD3Q01432 767 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 HYAL2Q12891 473 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 SQSTM1Q13501 440 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 SEPT6Q14141 434 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 STRN4Q9NRL3 753 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TMEM260Q9NX78 707 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 HCN2Q9UL51 889 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 A0A096LPE4 126 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 A0A1W2PPZ6 126 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 MCM4P33991 863 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 RASGRF1Q13972 1273 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 MPP2Q14168 576 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 HOMER1Q86YM7 354 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 GYS2P54840 703 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PLAURQ03405 335 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TKFCQ3LXA3 575 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 EFHC2Q5JST6 749 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 IFFO2Q5TF58 517 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 GK5Q6ZS86 529 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 NXPE3Q969Y0 559 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 PNMA5Q96PV4 448 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 CLCQ05315 142 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 C2orf27AQ580R0 203 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 ARSHQ5FYA8 562 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 REC114Q7Z4M0 266 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 SLC30A3Q99726 388 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 MUC3BQ9H195 1237 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 PPME1Q9Y570 386 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 CILPO75339 1184 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 MAP3K6O95382 1288 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 GJB6O95452 261 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 BMP1P13497 986 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms