RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497811.5

LINC00635-208, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00635, Length 856 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-208ENST00000497811 A0A096LPE4 126 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 A0A1W2PPZ6 126 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 F8W735 103 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 WISP1O95388 367 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 IKBKEQ14164 716 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 EHD4Q9H223 541 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00635-208ENST00000497811 ADAM11O75078 769 aa10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ALX3O95076 343 aa10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.2□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa10.19□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 C19orf57Q0VDD7 668 aa10.18□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 PI16Q6UXB8 463 aa10.18□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.18□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ARL4DP49703 201 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 NLRP12P59046 1061 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 GRM2Q14416 872 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ACAD11Q709F0 780 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ABCB6Q9NP58 842 aa10.17□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ITPKAP23677 461 aa10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 Q6ZS46 218 aa10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ADAM23O75077 832 aa10.15□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 MAPK8P45983 427 aa10.15□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 PCDH1Q08174 1060 aa10.15□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.15□□□□□ -0.78
LINC00635-208ENST00000497811 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 TP53INP1Q96A56 240 aa10.14□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF576Q9H609 170 aa10.14□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.14□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.14□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.13□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 SETDB2Q96T68 719 aa10.13□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 GLB1P16278 677 aa10.11□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 GSTM4Q03013 218 aa10.11□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 BCO2Q9BYV7 579 aa10.11□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.11□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.11□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.11□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 DYRK3O43781 588 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 B3GALT4O96024 378 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 ITGB7P26010 798 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 FBF1Q8TES7 1133 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 USP26Q9BXU7 913 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.09□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.09□□□□□ -0.79
LINC00635-208ENST00000497811 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 DLGAP3O95886 979 aa10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 FCGRTP55899 365 aa10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 CEP41Q9BYV8 373 aa10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 RNF208Q9H0X6 261 aa10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 FAAP100Q0VG06 881 aa10.07□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 PPP4R2Q9NY27 417 aa10.07□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 MEGF11A6BM72 1044 aa10.06□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 ATP2B2Q01814 1243 aa10.06□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10.06□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.06□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00635-208ENST00000497811 CYP11A1P05108 521 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms