RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	NFKBIE	O00221	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	TIAF1	O95411	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ADM	P35318	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	TRPA1	O75762	1119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PAPLN	O95428	1278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	USP11	P51784	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	OCLN	Q16625	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ZBTB39	O15060	712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	DRD2	P14416	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	RFX1	P22670	979 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF124	Q15973	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-222	ENST00000488576	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	DLGAP3	O95886	979 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	IKBKE	Q14164	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	STIM2	Q9P246	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	CES1	P23141	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	GATA6	Q92908	595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	BIN1	O00499	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	PKN1	Q16512	942 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	OSMR	Q99650	979 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	NFIC	P08651	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ADH5	P11766	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	RAB6A	P20340	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	GSTM4	Q03013	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	MAP7	Q14244	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM107B-222	ENST00000488576	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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