RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CASP7	P55210	303 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	FOXO4	P98177	505 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	SPTLC2	O15270	562 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620		A0A1W2PQ27	194 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620		A0A1W2PQ64	194 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620		A0A1W2PQD8	194 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620		A0A1B0GUL7	405 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CPLX1	O14810	134 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	TPM4	P67936	248 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ABCC6	O95255	1503 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF202	O95125	648 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	PRC1	O43663	620 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	NRDC	O43847	1150 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	MEGF6	O75095	1541 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	YEATS4	O95619	227 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CABP4	P57796	275 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	NLRP12	P59046	1061 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	NEDD4	P46934	1319 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620		H7C1W4	665 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	CYP27B1	O15528	508 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	PFKFB1	P16118	471 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	EYA2	O00167	538 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	FGA	P02671	866 aa		11.33	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.33	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.33	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.33	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.33	□□□□□ -0.59
ZNF3-215	ENST00000487620	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	EVC	P57679	992 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	FANCC	Q00597	558 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	NCAPH	Q15003	741 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TERF2	Q15554	542 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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