RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 CUX1P39880 1505 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 SYNJ1O43426 1573 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 F8W735 103 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 FSCN2O14926 492 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 COBLO75128 1261 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 EDN3P14138 238 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 HHIPQ96QV1 700 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 OSMRQ99650 979 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM19Q9H013 955 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 H3BRJ5 948 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 GLB1P16278 677 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 TXKP42681 527 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ACAD11Q709F0 780 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 NFKBIEO00221 500 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFB5O43674 189 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 TOPBP1Q92547 1522 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 WISP1O95388 367 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 PIP4K2BP78356 416 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 RNF112Q9ULX5 631 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 ARL4DP49703 201 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 BSNDQ8WZ55 320 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 WNT8BQ93098 351 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 SOX13Q9UN79 622 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 TOP2BQ02880 1626 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP12P59046 1061 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP4P98171 946 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 PDE3BQ13370 1112 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 TMC1Q8TDI8 760 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 NXPE3Q969Y0 559 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 CEP41Q9BYV8 373 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 WDR62O43379 1518 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM11O75078 769 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 NEFLP07196 543 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 IKBKEQ14164 716 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZS46 218 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 SOGA1O94964 1423 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 ECM1Q16610 540 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 TM4SF5O14894 197 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 CUX2O14529 1486 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-211ENST00000484135 METTL12A8MUP2 240 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 ORC1Q13415 861 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 HGSNATQ68CP4 663 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 FAM129BQ96TA1 746 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 USP26Q9BXU7 913 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
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