RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 GNG11P61952 73 aa20.64■□□□□ 0.9
PREB-208ENST00000468045 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.64■□□□□ 0.9
PREB-208ENST00000468045 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.64■□□□□ 0.9
PREB-208ENST00000468045 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.64■□□□□ 0.9
PREB-208ENST00000468045 MYL6BP14649 208 aa20.64■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.64■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.64■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 LMAN1P49257 510 aa20.64■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 H3BQF6 201 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 SPTLC2O15270 562 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 HOXB7P09629 217 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 TNNI3KQ59H18 835 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 ATP5JP18859 108 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 OSCARQ8IYS5 282 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PDILTQ8N807 584 aa20.63■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PFKFB1P16118 471 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 KIF28PB7ZC32 967 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 E7EWF7 191 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 DESI2Q9BSY9 194 aa20.62■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 KCNJ6P48051 423 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PNOCQ13519 176 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 AGLP35573 1532 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 A0A1W2PQ27 194 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 A0A1W2PQ64 194 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 A0A1W2PQD8 194 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 GOLIM4O00461 696 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 CASQ1P31415 396 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 FUT8Q9BYC5 575 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 FANCLQ9NW38 375 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.61■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 MYO1CO00159 1063 aa20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 HAND2P61296 217 aa20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 TMEM139Q8IV31 216 aa20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 DHX58Q96C10 678 aa20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 C8orf76Q96K31 380 aa20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 MYD88Q99836 296 aa20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 INTS13Q9NVM9 706 aa20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PIK3C2AO00443 1686 aa20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 ATL3Q6DD88 541 aa20.59■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 A0A0U1RQJ8 604 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 MAP3K9P80192 1104 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 PTPRUQ92729 1446 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.58■□□□□ 0.89
PREB-208ENST00000468045 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.58■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.58■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 AIFM3Q96NN9 605 aa20.58■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 PSME1Q06323 249 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 GPS2Q13227 327 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 SLC39A6Q13433 755 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 MCM6Q14566 821 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 VSTM4Q8IW00 320 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 LAMA4Q16363 1823 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 ABCC6O95255 1503 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 CDC27P30260 824 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 MTF1Q14872 753 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 CLIC6Q96NY7 704 aa20.57■□□□□ 0.88
PREB-208ENST00000468045 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms